Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CLN3Q13286 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CLN3Q13286 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
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