Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CBX3Q13185 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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