Protein–RNA interactions for Protein: Q13113

PDZK1IP1, PDZK1-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1IP1Q13113 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PDZK1IP1Q13113 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PDZK1IP1Q13113 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms