Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
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CHAF1BQ13112 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CHAF1BQ13112 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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