Protein–RNA interactions for Protein: Q13084

MRPL28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL28Q13084 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MRPL28Q13084 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MRPL28Q13084 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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