Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NFX1Q12986 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
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