Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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GTF3C1Q12789 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
GTF3C1Q12789 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
GTF3C1Q12789 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
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