Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FOXO1Q12778 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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