Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

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Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
SCAPQ12770 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SCAPQ12770 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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