Protein–RNA interactions for Protein: Q12751

RTP1, RNA polymerase II assembly factor RTP1, yeastyeast

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RTP1Q12751 LEE1YPL054W 906 nt1.97□□□□□ -2.09
RTP1Q12751 LHS1YKL073W 2646 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 MSC6YOR354C 2079 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 HMRA1YCR097W 381 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YPR170W-AYPR170W-A 186 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 DNF3YMR162C 4971 nt1.96□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 RPL31AYDL075W 342 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YDL152WYDL152W 366 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 SWF1YDR126W 1011 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 RPL42BYHR141C 321 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YHR210CYHR210C 1026 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 NFU1YKL040C 771 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 RPL42AYNL162W 321 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YOL159CYOL159C 516 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 CTR9YOL145C 3234 nt1.95□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YDR269CYDR269C 324 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 ATP6Q0085 780 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YER087C-AYER087C-A 552 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 TRX1YLR043C 312 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YPR099CYPR099C 357 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 NOP53YPL146C 1368 nt1.94□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 LRE1YCL051W 1752 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 URM1YIL008W 300 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 TMA22YJR014W 597 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YLR287CYLR287C 1068 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 ERP4YOR016C 624 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 RLM1YPL089C 2031 nt1.93□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 MDM20YOL076W 2391 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 MON2YNL297C 4911 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YER079WYER079W 633 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 YBR285WYBR285W 435 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 TDA9YML081W 3756 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 SBE22YHR103W 2559 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 FRK1YPL141C 2598 nt1.92□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 GNT1YOR320C 1476 nt1.91□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 SDH7YDR511W 402 nt1.91□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 SAR1YPL218W 573 nt1.91□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 MKT1YNL085W 2493 nt1.91□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 SAC3YDR159W 3906 nt1.9□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 DIE2YGR227W 1578 nt1.9□□□□□ -2.1
RTP1Q12751 PAN3YKL025C 2040 nt1.9□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 snR56snR56 88 nt1.9□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 CBS1YDL069C 690 nt1.9□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 MCM22YJR135C 720 nt1.9□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YLR334CYLR334C 381 nt1.89□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YOR053WYOR053W 342 nt1.89□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 FMP23YBR047W 528 nt1.89□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 PMD1YER132C 5262 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YDR118W-AYDR118W-A 117 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YER023C-AYER023C-A 213 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 ABM1YJR108W 372 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YBL071CYBL071C 309 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YBL073WYBL073W 312 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YCL046WYCL046W 324 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 VPS34YLR240W 2628 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 TBS1YBR150C 3285 nt1.88□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 SKI3YPR189W 4299 nt1.87□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YPL261CYPL261C 309 nt1.87□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 IRR1YIL026C 3453 nt1.87□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YLR422WYLR422W 5799 nt1.87□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YOR019WYOR019W 2193 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YHR138CYHR138C 345 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 PAU18YLL064C 363 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YMR230W-AYMR230W-A 189 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 PAU6YNR076W 363 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YPR012WYPR012W 255 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 TOF2YKR010C 2316 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 HSL1YKL101W 4557 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 OSH6YKR003W 1347 nt1.86□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 HMI1YOL095C 2121 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 RPS24BYIL069C 408 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 COA6YMR244C-A 315 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YNL114CYNL114C 372 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YPL185WYPL185W 396 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 CFT1YDR301W 4074 nt1.85□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 FIG2YCR089W 4830 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YGR265WYGR265W 411 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 YML009C-AYML009C-A 327 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 HUG1YML058W-A 207 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 UBC7YMR022W 498 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 MAK10YEL053C 2202 nt1.84□□□□□ -2.11
RTP1Q12751 UTP21YLR409C 2820 nt1.84□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 RTP1YMR185W 2946 nt1.84□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YAL068W-AYAL068W-A 255 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YLR434CYLR434C 384 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 MRPL50YNR022C 420 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 SPO24YPR036W-A 204 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 CHS1YNL192W 3396 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 HDA3YPR179C 1968 nt1.83□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 STF2YGR008C 255 nt1.82□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 RTT102YGR275W 474 nt1.82□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 YAR047CYAR047C 321 nt1.82□□□□□ -2.12
RTP1Q12751 SWI5YDR146C 2130 nt1.81□□□□□ -2.12
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