Protein–RNA interactions for Protein: Q12069

PUS9, tRNA pseudouridine(32) synthase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 462 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
PUS9Q12069 RGR1YLR071C 3249 nt2.7□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 APC11YDL008W 498 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 CFT2YLR115W 2580 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 SAP1YER047C 2694 nt2.69□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 ASG1YIL130W 2895 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 RAM2YKL019W 951 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 RPS17AYML024W 411 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 RPL33BYOR234C 324 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 YOR345CYOR345C 351 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 ESL1YIL151C 3357 nt2.68□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 FLO11YIR019C 4104 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 TFC8YPL007C 1767 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 PLC1YPL268W 2610 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 SIN3YOL004W 4611 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 YDR209CYDR209C 414 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 YOR333CYOR333C 417 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 RTC6YPL183W-A 282 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 ALK2YBL009W 2031 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 GIN4YDR507C 3429 nt2.67□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 PAN3YKL025C 2040 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 ECM12YHR021W-A 456 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 LSM7YNL147W 348 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 SSQ1YLR369W 1974 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 CAF120YNL278W 3183 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 TFC4YGR047C 3078 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 TOM1YDR457W 9807 nt2.66□□□□□ -1.98
PUS9Q12069 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 LCL1YPL056C 306 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YEL043WYEL043W 2871 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YJL070CYJL070C 2667 nt2.65□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 BAS1YKR099W 2436 nt2.64□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YMR31YFR049W 372 nt2.64□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 PFF1YBR074W 2931 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 ACM1YPL267W 630 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 PIG1YLR273C 1947 nt2.63□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 MPT5YGL178W 2580 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 CYR1YJL005W 6081 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 BRP1YGL007W 378 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YIR044CYIR044C 186 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 BCK1YJL095W 4437 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 BNR1YIL159W 4128 nt2.62□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 PSO2YMR137C 1986 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YJL022WYJL022W 309 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 CLN3YAL040C 1743 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 DNA2YHR164C 4569 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 COY1YKL179C 2040 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 BOI1YBL085W 2943 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 RLI1YDR091C 1827 nt2.61□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 COS111YBR203W 2775 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 TIM11YDR322C-A 291 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YER053C-AYER053C-A 114 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YOR218CYOR218C 420 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 EFR3YMR212C 2349 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 MMS1YPR164W 4224 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YER138CYER138C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YER160CYER160C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YJR027WYJR027W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YML039WYML039W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YML045WYML045W 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YMR050CYMR050C 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.6□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 RSE1YML049C 4086 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 ECM29YHL030W 5607 nt2.59□□□□□ -1.99
PUS9Q12069 PSK2YOL045W 3306 nt2.59□□□□□ -2
PUS9Q12069 SGD1YLR336C 2700 nt2.59□□□□□ -2
PUS9Q12069 SIR3YLR442C 2937 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 YBT1YLL048C 4986 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 YDR239CYDR239C 2364 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 YHL015W-AYHL015W-A 84 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 PUF4YGL014W 2667 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 YDR341CYDR341C 1824 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 ISW1YBR245C 3390 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 RLM1YPL089C 2031 nt2.58□□□□□ -2
PUS9Q12069 SUL1YBR294W 2580 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 MCM10YIL150C 1716 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 snR61snR61 90 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 YDR182W-AYDR182W-A 204 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 YOR102WYOR102W 351 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 YBR099CYBR099C 384 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 INP2YMR163C 2118 nt2.57□□□□□ -2
PUS9Q12069 PTC5YOR090C 1719 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 YPL150WYPL150W 2706 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 UBP15YMR304W 3693 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 RPO41YFL036W 4056 nt2.56□□□□□ -2
PUS9Q12069 VPH1YOR270C 2523 nt2.56□□□□□ -2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.8 ms