Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 RAD4YER162C 2265 nt3.63□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 snR76snR76 109 nt3.63□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.63□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 SIZ1YDR409W 2715 nt3.63□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 YOR019WYOR019W 2193 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 SMY2YBR172C 2223 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 FMP16YDR070C 282 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 STF2YGR008C 255 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 NOP10YHR072W-A 177 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 CHO2YGR157W 2610 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 MDV1YJL112W 2145 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 KSP1YHR082C 3090 nt3.62□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 HOS4YIL112W 3252 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 EPL1YFL024C 2499 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RPL31AYDL075W 342 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 YIL134C-AYIL134C-A 204 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RPL20AYMR242C 519 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 SNT1YCR033W 3681 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RRP12YPL012W 3687 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 PTP3YER075C 2787 nt3.61□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 YFL065CYFL065C 309 nt3.6□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 RPS28BYLR264W 204 nt3.6□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 ATG26YLR189C 3597 nt3.6□□□□□ -1.83
TFB4Q12004 FRE2YKL220C 2136 nt3.59□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 SPT6YGR116W 4356 nt3.59□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 URA2YJL130C 6645 nt3.59□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 UBP14YBR058C 2346 nt3.59□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 HRD3YLR207W 2502 nt3.59□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YPR022CYPR022C 3402 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 MET5YJR137C 4329 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YPR089WYPR089W 2667 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 UTP14YML093W 2700 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YKU80YMR106C 1890 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 SWI5YDR146C 2130 nt3.58□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 STE23YLR389C 3084 nt3.57□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YFR016CYFR016C 3702 nt3.57□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 RSF2YJR127C 4143 nt3.57□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 RIC1YLR039C 3171 nt3.57□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 PSY2YNL201C 2577 nt3.57□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YNL144CYNL144C 2223 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 ROG1YGL144C 2058 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 PIP2YOR363C 2991 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 LYS14YDR034C 2373 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 FUN30YAL019W 3396 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 PUT3YKL015W 2940 nt3.56□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 YDL242WYDL242W 354 nt3.55□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 FAT1YBR041W 2010 nt3.54□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 IRR1YIL026C 3453 nt3.54□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 EDS1YBR033W 2760 nt3.54□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 SUL1YBR294W 2580 nt3.54□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 SCH9YHR205W 2475 nt3.54□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 INP52YNL106C 3552 nt3.53□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 RAD5YLR032W 3510 nt3.53□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 DNL4YOR005C 2835 nt3.53□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 PRP6YBR055C 2700 nt3.53□□□□□ -1.84
TFB4Q12004 DAN4YJR151C 3486 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 MAK21YDR060W 3078 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 snR62snR62 100 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 MTR4YJL050W 3222 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 ENA2YDR039C 3276 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 ENA1YDR040C 3276 nt3.52□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RDS1YCR106W 2499 nt3.51□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 STB4YMR019W 2850 nt3.51□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RPS30BYOR182C 192 nt3.51□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 SPA2YLL021W 4401 nt3.51□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 SET1YHR119W 3243 nt3.5□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.5□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt3.5□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RTT10YPL183C 3042 nt3.5□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 MNL2YLR057W 2550 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 YPR203WYPR203W 309 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 KAP123YER110C 3342 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 TAE2YPL009C 3117 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 SLD3YGL113W 2007 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 TFC1YBR123C 1950 nt3.49□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 CHS6YJL099W 2241 nt3.48□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 KAP104YBR017C 2757 nt3.48□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 SPO22YIL073C 2928 nt3.48□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RAD2YGR258C 3096 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 SBE22YHR103W 2559 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 YTA7YGR270W 4140 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 BMS1YPL217C 3552 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RAD34YDR314C 2079 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 RCO1YMR075W 2055 nt3.47□□□□□ -1.85
TFB4Q12004 OSH3YHR073W 2991 nt3.46□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 SPO71YDR104C 3738 nt3.46□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 RGA2YDR379W 3030 nt3.46□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 YBT1YLL048C 4986 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 RPN1YHR027C 2982 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 PAU8YAL068C 363 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 PAU18YLL064C 363 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 COX12YLR038C 252 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 PAU6YNR076W 363 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 PAU20YOL161C 363 nt3.45□□□□□ -1.86
TFB4Q12004 STT4YLR305C 5703 nt3.45□□□□□ -1.86
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