Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
APOBRQ0VD83 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APOBRQ0VD83 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms