Protein–RNA interactions for Protein: Q0PNE2

ELP6, Elongator complex protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP6Q0PNE2 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ELP6Q0PNE2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms