Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
CAMSAP2Q08AD1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CAMSAP2Q08AD1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms