Protein–RNA interactions for Protein: Q08380

LGALS3BP, Galectin-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3BPQ08380 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LGALS3BPQ08380 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LGALS3BPQ08380 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms