Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 YIL080WYIL080W 4722 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 SSM4YIL030C 3960 nt3.53□□□□□ -1.84
BUD20Q08004 ALA1YOR335C 2877 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RCO1YMR075W 2055 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YJR112W-AYJR112W-A 330 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RPL20AYMR242C 519 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 PDR12YPL058C 4536 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 PRP5YBR237W 2550 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 UBP14YBR058C 2346 nt3.52□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 EPL1YFL024C 2499 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 SLX4YLR135W 2247 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 SEC63YOR254C 1992 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 ZIP1YDR285W 2628 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 SIZ1YDR409W 2715 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 KAP104YBR017C 2757 nt3.51□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YPR089WYPR089W 2667 nt3.5□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 PUT3YKL015W 2940 nt3.5□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RPS8AYBL072C 603 nt3.5□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RPL42AYNL162W 321 nt3.5□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 SLD3YGL113W 2007 nt3.49□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 PTP3YER075C 2787 nt3.49□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 PHM6YDR281C 315 nt3.49□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RPS30BYOR182C 192 nt3.49□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YKU80YMR106C 1890 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 INP52YNL106C 3552 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YPR022CYPR022C 3402 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YFL065CYFL065C 309 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YAL037C-AYAL037C-A 93 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YPR203WYPR203W 309 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 YGL140CYGL140C 3660 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 DIA2YOR080W 2199 nt3.48□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 RAD2YGR258C 3096 nt3.47□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 KSP1YHR082C 3090 nt3.47□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 FUN30YAL019W 3396 nt3.47□□□□□ -1.85
BUD20Q08004 SWI5YDR146C 2130 nt3.46□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 SEG1YMR086W 2883 nt3.46□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 FAS1YKL182W 6156 nt3.46□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 RIC1YLR039C 3171 nt3.45□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 snR76snR76 109 nt3.45□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 DAN4YJR151C 3486 nt3.44□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 LYS14YDR034C 2373 nt3.44□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 STE11YLR362W 2154 nt3.44□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 RGM1YMR182C 636 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YPR108W-AYPR108W-A 213 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 RTT10YPL183C 3042 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 XRS2YDR369C 2565 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 KRE5YOR336W 4098 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 UTP8YGR128C 2142 nt3.43□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 SLM1YIL105C 2061 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 SCH9YHR205W 2475 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 tV(CAC)DtV(CAC)D 73 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 tV(CAC)HtV(CAC)H 73 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YLR154C-HYLR154C-H 132 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YLR156C-AYLR156C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YLR157C-CYLR157C-C 132 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YLR159C-AYLR159C-A 132 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YNL266WYNL266W 420 nt3.42□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 RAD26YJR035W 3258 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 KAP123YER110C 3342 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 NOP10YHR072W-A 177 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 COX12YLR038C 252 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 STE23YLR389C 3084 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 RPO21YDL140C 5202 nt3.41□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 YAT2YER024W 2772 nt3.4□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 IKI3YLR384C 4050 nt3.4□□□□□ -1.86
BUD20Q08004 QCR9YGR183C 201 nt3.4□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 ANB1YJR047C 474 nt3.4□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 SET2YJL168C 2202 nt3.4□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 SUL1YBR294W 2580 nt3.4□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 MAK21YDR060W 3078 nt3.4□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 RRP12YPL012W 3687 nt3.39□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 SWI1YPL016W 3945 nt3.39□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 IRC8YJL051W 2469 nt3.39□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 MNL2YLR057W 2550 nt3.39□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 IRR1YIL026C 3453 nt3.38□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YHR131W-AYHR131W-A 246 nt3.38□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 RAD34YDR314C 2079 nt3.38□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 ROG1YGL144C 2058 nt3.38□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 RPA135YPR010C 3612 nt3.38□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 NUP159YIL115C 4383 nt3.37□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 ATG26YLR189C 3597 nt3.37□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 PSY2YNL201C 2577 nt3.37□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YNL018CYNL018C 1839 nt3.37□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 LRG1YDL240W 3054 nt3.37□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt3.36□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt3.36□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 HSH155YMR288W 2916 nt3.36□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 PKH1YDR490C 2301 nt3.36□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 MYO3YKL129C 3819 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 RAD5YLR032W 3510 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YLL054CYLL054C 2532 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 HRD3YLR207W 2502 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 MDN1YLR106C 14733 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YGL182CYGL182C 324 nt3.35□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YDR034C-AYDR034C-A 177 nt3.34□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 SPT4YGR063C 309 nt3.34□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt3.34□□□□□ -1.87
BUD20Q08004 SPA2YLL021W 4401 nt3.34□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 84.9 ms