Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
FMODQ06828 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
FMODQ06828 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
FMODQ06828 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
FMODQ06828 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms