Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 OR13I1P-201ENST00000609811 1264 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
TNP2Q05952 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms