Protein–RNA interactions for Protein: Q05215

EGR4, Early growth response protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR4Q05215 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EGR4Q05215 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms