Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHRNEQ04844 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHRNEQ04844 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms