Protein–RNA interactions for Protein: Q04712

RRN11, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN11, yeastyeast

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11Q04712 DAD4YDR320C-A 219 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YIL066W-AYIL066W-A 444 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 SNC1YAL030W 354 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YBL073WYBL073W 312 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 SCH9YHR205W 2475 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 TRL1YJL087C 2484 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 CFT2YLR115W 2580 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 STB4YMR019W 2850 nt1.92□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YNL144CYNL144C 2223 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 FMP16YDR070C 282 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YDR102CYDR102C 333 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 YGL024WYGL024W 336 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 PHS1YJL097W 654 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 IRC23YOR044W 474 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 CDC53YDL132W 2448 nt1.91□□□□□ -2.1
RRN11Q04712 CDC50YCR094W 1176 nt1.9□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YKL136WYKL136W 399 nt1.9□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 RPL32YBL092W 393 nt1.9□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 DNF3YMR162C 4971 nt1.9□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YDL118WYDL118W 381 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YDR413CYDR413C 576 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YER097WYER097W 330 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YGL239CYGL239C 315 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YJL020W-AYJL020W-A 258 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 SNC2YOR327C 348 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YOR333CYOR333C 417 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YPR099CYPR099C 357 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YSY6YBR162W-A 198 nt1.89□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YGL069CYGL069C 465 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YKL083WYKL083W 615 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YKL118WYKL118W 312 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YOR199WYOR199W 330 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 LHS1YKL073W 2646 nt1.88□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 UTP21YLR409C 2820 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 MNE1YOR350C 1992 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 SGD1YLR336C 2700 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 CSN9YDR179C 489 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YHL037CYHL037C 402 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 UBR2YLR024C 5619 nt1.87□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 NOT5YPR072W 1683 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 CAT2YML042W 2013 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 MMS22YLR320W 4365 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YDL152WYDL152W 366 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 HOP2YGL033W 657 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 HSK3YKL138C-A 210 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YLR053CYLR053C 327 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YMR247W-AYMR247W-A 144 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 BIL1YOR304C-A 231 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YPR010C-AYPR010C-A 219 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YBR224WYBR224W 516 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 PAC1YOR269W 1485 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.86□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 DOT6YER088C 2013 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YFL032WYFL032W 321 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 TIM13YGR181W 318 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YBL012CYBL012C 402 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YLR419WYLR419W 4308 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 SFB2YNL049C 2631 nt1.85□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 PAN3YKL025C 2040 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YBP1YBR216C 2025 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 NUP192YJL039C 5052 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 SEC31YDL195W 3822 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YOR231C-AYOR231C-A 201 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YPL182CYPL182C 384 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.84□□□□□ -2.11
RRN11Q04712 YOR093CYOR093C 4947 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 HSH155YMR288W 2916 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 PKH3YDR466W 2697 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 RBK1YCR036W 1002 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YPL229WYPL229W 621 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 snR36snR36 182 nt1.83□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 RPL37BYDR500C 267 nt1.82□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YER181CYER181C 324 nt1.82□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 MEC1YBR136W 7107 nt1.82□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YLR149CYLR149C 2193 nt1.82□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 CDC27YBL084C 2277 nt1.82□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 MYO4YAL029C 4416 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 RPL35AYDL191W 363 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YHL041WYHL041W 450 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YMR141W-AYMR141W-A 225 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 SAR1YPL218W 573 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 AIM9YER080W 1884 nt1.81□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 HER1YOR227W 3741 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 SGO1YOR073W 1773 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 SYH1YPL105C 2550 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 HCS1YKL017C 2052 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 MAM33YIL070C 801 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YML099W-AYML099W-A 330 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YBL083CYBL083C 426 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 GRR1YJR090C 3456 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 SBE22YHR103W 2559 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YDR341CYDR341C 1824 nt1.8□□□□□ -2.12
RRN11Q04712 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt1.79□□□□□ -2.12
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