Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ATP7AQ04656 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ATP7AQ04656 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms