Protein–RNA interactions for Protein: Q03530

RCE1, CAAX prenyl protease 2, yeastyeast

Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RCE1Q03530 SLX9YGR081C 633 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 RPL42BYHR141C 321 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 RCN1YKL159C 636 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 HUG1YML058W-A 207 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 RPL42AYNL162W 321 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YOL029CYOL029C 606 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YHR214C-CYHR214C-C 1437 nt0.86□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 SNF5YBR289W 2718 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YFL012WYFL012W 447 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YKL111CYKL111C 336 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YLR252WYLR252W 306 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 DDR48YMR173W 1293 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YNL319WYNL319W 441 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 SMY1YKL079W 1971 nt0.85□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 QCR7YDR529C 384 nt0.84□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 CHZ1YER030W 462 nt0.84□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 IES5YER092W 378 nt0.84□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YKL183C-AYKL183C-A 213 nt0.84□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 YPR146CYPR146C 330 nt0.84□□□□□ -2.27
RCE1Q03530 SMC1YFL008W 3678 nt0.84□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 SCC2YDR180W 4482 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YER188C-AYER188C-A 300 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 RPL40BYKR094C 387 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 HHT1YBR010W 411 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 IRC16YPR038W 360 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 CLU1YMR012W 3834 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YBR184WYBR184W 1572 nt0.83□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YDL016CYDL016C 303 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YDL152WYDL152W 366 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YER175W-AYER175W-A 165 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 PRM8YGL053W 714 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 SPO13YHR014W 876 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YHR028W-AYHR028W-A 321 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 VPS54YDR027C 2670 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 EAF1YDR359C 2949 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YAR009CYAR009C 3591 nt0.82□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YPR117WYPR117W 7470 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 SRP14YDL092W 441 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 SMB1YER029C 591 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YGL217CYGL217C 342 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 VMA21YGR105W 234 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YIL029CYIL029C 429 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 NBP1YLR457C 960 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 snR14snR14 160 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YOR376WYOR376W 369 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YPR063CYPR063C 423 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 IFH1YLR223C 3258 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 AZF1YOR113W 2745 nt0.81□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 MUK1YPL070W 1839 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 UFD2YDL190C 2886 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YGR265WYGR265W 411 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 EMC5YIL027C 426 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 PAM16YJL104W 450 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 AFB1YLR040C 675 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YOR029WYOR029W 336 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 CDC39YCR093W 6327 nt0.8□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YDL211CYDL211C 1119 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 PAU2YEL049W 363 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YHL009W-AYHL009W-A 1242 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 TMA22YJR014W 597 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YJR141WYJR141W 1044 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YKL044WYKL044W 321 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 GMC2YLR445W 567 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 RPS18BYML026C 441 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 RAD50YNL250W 3939 nt0.79□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 ZRG17YNR039C 1818 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YDR509WYDR509W 348 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YKL023C-AYKL023C-A 228 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 UBX4YMR067C 1251 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 TIM18YOR297C 579 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 YPR099CYPR099C 357 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 SLX4YLR135W 2247 nt0.78□□□□□ -2.28
RCE1Q03530 HDA3YPR179C 1968 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 HNT1YDL125C 477 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YER135CYER135C 393 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SPC1YJR010C-A 285 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YKL068W-AYKL068W-A 237 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 FMP23YBR047W 528 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YOR192C-AYOR192C-A 1317 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 PPN1YDR452W 2025 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 COG4YPR105C 2586 nt0.77□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 KAP120YPL125W 3099 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 PAN3YKL025C 2040 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 BUD3YCL014W 4911 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 PAC1YOR269W 1485 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 snR84snR84 550 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YLL020CYLL020C 306 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 ERP4YOR016C 624 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YOP1YPR028W 543 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 PAU24YBR301W 363 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YCS4YLR272C 3531 nt0.76□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SNU56YDR240C 1479 nt0.75□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 SEC3YER008C 4011 nt0.75□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YDR008CYDR008C 351 nt0.75□□□□□ -2.29
RCE1Q03530 YBL073WYBL073W 312 nt0.75□□□□□ -2.29
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 60.1 ms