Protein–RNA interactions for Protein: Q03393

PTS, 6-pyruvoyl tetrahydrobiopterin synthase, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTSQ03393 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTSQ03393 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTSQ03393 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PTSQ03393 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PTSQ03393 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PTSQ03393 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PTSQ03393 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms