Protein–RNA interactions for Protein: Q02928

CYP4A11, Cytochrome P450 4A11, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4A11Q02928 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CYP4A11Q02928 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CYP4A11Q02928 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms