Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN7AQ01118 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN7AQ01118 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms