Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
HSF1Q00613 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms