Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GTF2BQ00403 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GTF2BQ00403 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms