Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FAM3AP98173 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FAM3AP98173 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
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FAM3AP98173 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
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FAM3AP98173 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FAM3AP98173 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
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