Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IRX3P78415 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
IRX3P78415 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
IRX3P78415 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
IRX3P78415 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms