Protein–RNA interactions for Protein: P62851

RPS25, 40S ribosomal protein S25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS25P62851 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPS25P62851 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPS25P62851 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RPS25P62851 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms