Protein–RNA interactions for Protein: P62684

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P62684 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HERVK_113P62684 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HERVK_113P62684 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms