Protein–RNA interactions for Protein: P62491

RAB11A, Ras-related protein Rab-11A, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11AP62491 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB11AP62491 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms