Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ARF6P62330 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ARF6P62330 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ARF6P62330 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ARF6P62330 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms