Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
POLR2FP61218 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
POLR2FP61218 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms