Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ERVPABLB-1P60509 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ERVPABLB-1P60509 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms