Protein–RNA interactions for Protein: P59045

NLRP11, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,033 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP11P59045 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NLRP11P59045 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms