Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LOXL3P58215 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LOXL3P58215 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms