Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NUP107P57740 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NUP107P57740 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
NUP107P57740 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NUP107P57740 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms