Protein–RNA interactions for Protein: P57729

RAB38, Ras-related protein Rab-38, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB38P57729 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB38P57729 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB38P57729 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB38P57729 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB38P57729 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB38P57729 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAB38P57729 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RAB38P57729 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms