Protein–RNA interactions for Protein: P57078

RIPK4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 832 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPK4P57078 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
RIPK4P57078 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms