Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GSCP56915 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GSCP56915 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GSCP56915 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GSCP56915 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GSCP56915 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
GSCP56915 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms