Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CLDN15P56746 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CLDN15P56746 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms