Protein–RNA interactions for Protein: P55201

BRPF1, Peregrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF1P55201 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
BRPF1P55201 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BRPF1P55201 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BRPF1P55201 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms