Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB3P54284 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CACNB3P54284 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms