Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATN1P54259 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATN1P54259 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATN1P54259 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATN1P54259 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATN1P54259 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms