Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AP3M2P53677 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
AP3M2P53677 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
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