Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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PGGT1BP53609 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PGGT1BP53609 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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