Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBP2P50120 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBP2P50120 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBP2P50120 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
RBP2P50120 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms